近日，我所擬穴青蟹項目組在擬穴青蟹轉錄組高通量454測序、組裝與注釋、信號通路分析、分子標記挖掘及與生長性狀相關的微衛星標記篩選研究中取得一系列新進展，研究成果相繼發表在PLoS ONE、Molecular Biology Reports、Gene等國際期刊上。
擬穴青蟹屬大型海水蟹類，是我國重要的海水養殖和捕撈對象。項目組在國家自然科學基金項目、上海市科委基礎研究重點項目、中央級科研院所基本科研業務費項目等資助下，利用454二代測序技術對擬穴青蟹轉錄組進行了深度測序，現已獲得540 Mbp的數據量、131萬條高質量reads、76000多條contigs及78000多個unigenes；同時，還鑒定出1.9萬多個微衛星序列和3.6萬多個SNP位點。
項目組針對轉錄組來源的信息進行深入挖掘和應用，共開發出164個多態性微衛星標記，驗證了91個SNP位點，獲得了線粒體全基因組序列，其中3個微衛星標記(Scpa36、Scpa75、Spm30)與12個表型生長性狀之間具有顯著的相關性(P < 0.05)，初步確定了Scpa36位點的BC基因型、Scpa75位點的BC和BD基因型及Spm30位點的AC基因型在擬穴青蟹選擇育種中具有最大的輔助育種潛力。
該研究將促進擬穴青蟹及其相近物種的功能基因組學、種群保護遺傳學和分子輔助育種學研究的發展。
（遺傳育種與生物技術實驗室 馬洪雨）
