東海水產研究所浙江寧海試驗基地占地200畝，位于浙江省寧海縣一市鎮三門灣現代農業開發區內，緊鄰海水養殖區域，區域氣候環境適宜研究種類的繁殖與生長，水質和地質良好。基地擁有實驗樓2棟2600平米，科研儀器設備53臺（套）。輔助樓1棟450平米、試驗車間4300平米、室外養殖池40畝、養殖溫室3000平米。基地配備有海水反滲透裝置和控溫設備，可根據生產與科研要求調節海水鹽度和海水水溫；擁有水下彩色攝像系統、解剖鏡、顯微鏡、細胞計數與活力分析儀、全自動核酸提取工作站、全自動核酸分析儀等設備53臺（套）。2020年被評為浙江省省級健康養殖示范場，2023年被評為農業農村部信息化示范基地。 寧海基地一直按照“科技創新、人才培養、成果轉化、國際交流”四位一體模式，圍繞種業的“研繁育推”一體化的綜合性科研基地，重點圍繞青蟹、南美白對蝦、縊蟶、梭子蟹、鰻鱺等東海區域名特優海水養殖種類，開展種質資源創新、新品種創制、良種規模化擴繁、生態綠色養殖等領域關鍵技術攻關和成果轉化應用，為實現水產種業科技自立自強、種源自主可控和浙江種業強省建設貢獻力量。
